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Les travaux de cette thèse portent sur l'observation et la commande des systèmes dynamiques d'ordre non entier. Dans un premier temps, nous présentons la conception et la synthèse de différents types d'observateurs (d'ordres plein et réduit, ainsi que fonctionnels) pour les systèmes dynamiques d'ordre non entier dans le cas linéaire avec des retards variant dans le temps, tout en intégrant la robustesse vis-à-vis des incertitudes paramétriques et des perturbations exogènes. Une deuxième partie de ce travail présente la conception de lois de commande basées sur les observateurs évoqués ci-dessus pour des systèmes dynamiques incertains d'ordre non entier en présence de perturbations exogènes. Par la suite, afin d'assurer une stabilisation robuste vis-à-vis des incertitudes et le rejet de l'effet des perturbations sur les erreurs d'estimation et sur les variables à contrôler, deux approches sont adoptées. La première est basée sur la matrice hamiltonienne et la deuxième sur le lemme de Kalman-Yakubovich-Popov (KYP).